Museets bestyrelse sammensættes og udpeges som følger:

• En person med indsigt i politisk beslutningsprocesser på regionalt og statsligt niveau - udpeget af Vikingeskibsmuseets Venner

• Et medlem af byrådet i Roskilde Kommune - udpeget af Roskilde byråd
• En person med relevant kompetence for museets strategiplan- udpeget af Vikingeskibsmuseets  Venner
• En person med forskningskompetence - udpeget af Vikingeskibsmuseets Venner (for øjeblikket vakant)
• En person med erhvervskompetence fra en større virksomhed - udpeget af Dansk Industri

Bestyrelsens sammensætning er som følger:

• Formand Poul Lindor Nielsen, borgmester, Roskilde Kommune
• Næstformand Leo Bjørnskov, tidligere departementschef (formand i Vikingeskibsmuseets venner)
• Gurli Martinussen, direktør (bestyrelsesmedlem i Vikingeskibsmuseets venner)
• Lars Fredsted, adm. direktør